本发明涉及一种反胶束提取菜籽蛋白的方法，该方法工艺简单，不需要加入大量的酸和碱，生产成本低，操作条件温和，产品纯度高，蛋白提取率高。所述反胶束提取菜籽蛋白的方法包括以下步骤：将菜籽粕粉加入反胶束溶液中，萃取，然后经固液分离得到菜籽蛋白溶液。作为优选方案，反胶束溶液由丁二酸二异辛酯磺酸钠、异辛烷和含有K+的缓冲溶液混合而成。菜籽粕粉的加入量为0.001～0.20g/mL。作为本发明的改进，所述萃取在超声波作用下进行。优选超声波的频率20KHz，功率100KW。本发明工艺简单，不需要加入大量的酸和碱，生产成本低，操作条件温和，产品纯度高，蛋白提取率高。