本发明涉及一种燃料电池碳载钯基双金属催化剂，是碳载的钯/钨或钯/钼复合颗粒，钯/钨或钯/钼均匀附着在碳载体表面，钯和钨(或钼)的重量含量分别为1％～20％、5％～30％；由含钨或含钼的盐溶液与碳均匀混合，经干燥及高温焙烧得前驱体碳载金属氧化物，将其与氯钯酸钠溶液混合，400℃～900℃下通入氢气，将金属氧化物还原，即制得碳载钯基双金属电极催化剂。本发明利用钯离子能定向选择性地吸附在金属氧化物表面的特性，使催化剂中的金属Pd和促进金属形成互相紧密结合的双金属颗粒并均匀分散在载体碳表面，提高了金属钯的效率，改善了电池电极催化剂的催化性能。