本发明涉及复合材料技术领域，提供了一种三嗪类双模版分子印迹聚合物及其制备方法和应用。本发明利用灭蝇胺和三聚氰胺作为双模板分子，双模板分子可以增加聚合物吸附位点的准确性，从而达到对多种三嗪类农药的高效吸附的目的。实验结果表明，采用本发明制备的三嗪类双模版分子印迹聚合物检测苹果、黄瓜、玉米中四种三嗪类农药，四种三嗪类农药加标浓度为0.1~0.5 ug/mL范围内的平均回收率为72.7~109.2%(n-3)，多次测量的标准偏差为1.3~4.9%，且检出限较低，能够用于三嗪类农药的痕量检测。