本发明公开了一种黄曲霉毒素B1适配体亲和毛细管整体柱的制备及应用，将氨基修饰的黄曲霉毒素Bl适配体通过戊二醛偶联接枝修饰于有机-无机杂化的氨基毛细管整体柱，通过适配体与黄曲霉毒素B1特异性亲和作用，有机-无机杂化整体柱高的柱渗透性和大的比表面积，可以高灵敏、高选择性地分离、富集复杂食品样品中痕量、超痕量黄曲霉毒素 B1，与检测仪器联用可实现黄曲霉毒素B1简便、灵敏、快速检测。