本发明涉及一种从金针菇菇根中提取具有细胞免疫活性多糖的方法，属于生物医药领域。金针菇菇根是金针菇加工过程中，作为废料被切除的根蒂部分，将金针菇菇根烘干、粉碎，制得金针菇菇根超微粉。先将粉碎后的超微粉，加适量85%乙醇室温下浸泡2h，离心取沉淀，以原料为基准，按水料比28mL/g加去离子水，于680W超声处理19.8min，离心取上清液，上清液旋转蒸发浓缩至适量，浓缩液加4倍体积无水乙醇，4℃下沉淀12h，离心取沉淀，沉淀物置60℃烘箱烘干，即得到金针菇菇根粗多糖。采用超声波提取技术，多糖得率为16.20%，与传统的热水浸提相比，得率提高了70%，时间缩短了92%。